MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100 megaplasmid pCL2100

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012040	TGTT	2	8	1328	1335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012040	TAAT	2	8	1369	1376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012040	T	6	6	1383	1388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012040	TGTTT	2	10	7219	7228	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012040	ATT	2	6	7284	7289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012040	AT	4	8	7297	7304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012040	TA	3	6	7327	7332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012040	T	6	6	7337	7342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012040	ATT	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012040	ATT	2	6	8004	8009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012040	TAT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012040	T	6	6	8020	8025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012040	GTAT	2	8	8030	8037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012040	TA	3	6	8050	8055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012040	T	6	6	8059	8064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012040	AT	3	6	8065	8070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012040	TACA	2	8	8071	8078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012040	TAT	2	6	9023	9028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012040	AT	3	6	9027	9032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012040	AT	4	8	9073	9080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012040	A	6	6	9081	9086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012040	ATTT	2	8	9097	9104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012040	CTATA	2	10	9111	9120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012040	CAATAA	2	12	9121	9132	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012040	A	6	6	9131	9136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012040	T	6	6	9145	9150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012040	AAGT	2	8	9158	9165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012040	TGTTT	2	10	9185	9194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012040	ATT	2	6	9214	9219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012040	TAA	2	6	9225	9230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012040	A	6	6	9240	9245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012040	ATTT	2	8	9248	9255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012040	ACA	2	6	9256	9261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012040	TAT	2	6	10112	10117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012040	TAA	2	6	10248	10253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012040	AG	3	6	10282	10287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012040	T	6	6	10291	10296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012040	AT	3	6	10311	10316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012040	TAT	2	6	10319	10324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012040	AT	3	6	10323	10328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012040	TA	3	6	10332	10337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012040	TA	4	8	10350	10357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012040	A	6	6	10421	10426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012040	TA	3	6	10433	10438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012040	TA	3	6	10440	10445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012040	A	6	6	10464	10469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012040	A	7	7	10474	10480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012040	TATT	2	8	10481	10488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012040	ATAAA	2	10	10493	10502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012040	ATTT	2	8	10507	10514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012040	TA	3	6	10531	10536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012040	TTG	2	6	10895	10900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012040	ATC	2	6	10922	10927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012040	T	6	6	10951	10956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012040	TCT	2	6	10967	10972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012040	AT	3	6	10982	10987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012040	AAAT	2	8	11042	11049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012040	GAAA	2	8	11057	11064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012040	T	6	6	11074	11079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012040	AT	3	6	11084	11089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012040	TCT	2	6	11090	11095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012040	CTT	2	6	11154	11159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012040	T	7	7	11170	11176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012040	T	6	6	11189	11194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012040	A	8	8	11229	11236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012040	TTA	2	6	11240	11245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012040	TTTAAT	2	12	11250	11261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012040	A	6	6	11262	11267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012040	ATA	2	6	11278	11283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012040	TCGT	2	8	11314	11321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012040	T	6	6	11324	11329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012040	AAAG	2	8	15993	16000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012040	CAAAG	2	10	16081	16090	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012040	ATT	2	6	16092	16097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012040	ATA	2	6	16101	16106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012040	T	6	6	16117	16122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012040	TTA	2	6	16153	16158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012040	GCC	2	6	16172	16177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012040	CTT	2	6	16209	16214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012040	AAG	2	6	16297	16302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012040	TAATT	2	10	16370	16379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012040	A	7	7	16454	16460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012040	GAA	2	6	16467	16472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012040	AAAG	2	8	17333	17340	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012040	AAAG	2	8	17346	17353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012040	TAA	2	6	17404	17409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012040	ACAA	2	8	17427	17434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012040	TAT	2	6	17533	17538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012040	TCT	2	6	17546	17551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012040	CTT	2	6	17556	17561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012040	AAT	2	6	17569	17574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012040	AAAG	2	8	19080	19087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012040	CAAAG	2	10	19154	19163	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_012040	CTT	2	6	19281	19286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012040	AATT	2	8	19316	19323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012040	ATA	2	6	25856	25861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012040	AACC	2	8	25871	25878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012040	AGAAA	2	10	25911	25920	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012040	AAG	2	6	25928	25933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012040	A	7	7	25936	25942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012040	A	8	8	25945	25952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012040	TA	4	8	27514	27521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012040	T	8	8	27522	27529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012040	A	6	6	27550	27555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012040	TTA	2	6	27572	27577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012040	TTA	2	6	28268	28273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012040	TA	3	6	35168	35173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012040	T	6	6	35182	35187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012040	AAATC	2	10	35225	35234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012040	TTA	2	6	35665	35670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012040	A	7	7	35691	35697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012040	TTA	2	6	36263	36268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012040	ATAATT	2	12	36316	36327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012040	TTA	2	6	36361	36366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012040	AGG	2	6	36375	36380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012040	TAT	2	6	36406	36411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012040	TAAGA	2	10	36446	36455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012040	A	6	6	36467	36472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012040	TA	3	6	36562	36567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012040	ATT	2	6	36570	36575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012040	ATT	2	6	36593	36598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012040	CAT	2	6	36622	36627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012040	ATAA	2	8	36674	36681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012040	AAT	2	6	36683	36688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012040	TA	3	6	36696	36701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012040	AGG	2	6	36777	36782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012040	A	6	6	36792	36797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012040	TAAGA	2	10	36848	36857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012040	T	6	6	36866	36871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012040	ATT	2	6	36903	36908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012040	T	6	6	36930	36935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012040	TTTAT	2	10	36949	36958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012040	A	6	6	37626	37631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012040	TAG	2	6	37643	37648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012040	A	7	7	37652	37658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012040	A	6	6	37661	37666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012040	AACG	2	8	37668	37675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012040	ATTA	2	8	37707	37714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012040	TAAT	2	8	37725	37732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012040	TAAT	2	8	38415	38422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012040	T	6	6	38424	38429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012040	A	6	6	38471	38476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012040	AGT	2	6	38819	38824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012040	T	6	6	38838	38843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012040	ATTT	2	8	38864	38871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012040	TAAAT	2	10	38875	38884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012040	AAT	2	6	38904	38909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012040	AT	3	6	38908	38913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012040	ACTA	2	8	38936	38943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012040	TATT	2	8	40196	40203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012040	TTAAT	2	10	40204	40213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012040	TGA	2	6	40233	40238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012040	TAG	2	6	40255	40260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012040	A	6	6	42324	42329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012040	ATT	2	6	42339	42344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012040	A	6	6	42350	42355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012040	A	7	7	42372	42378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012040	ATT	2	6	42410	42415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012040	T	6	6	42430	42435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012040	T	6	6	42438	42443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012040	CAC	2	6	42446	42451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_012040	GA	3	6	42539	42544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012040	T	6	6	42546	42551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012040	TCT	2	6	42563	42568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_012040	A	6	6	42587	42592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012040	AAT	2	6	42621	42626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012040	ATT	2	6	42643	42648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012040	TAA	3	9	42664	42672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012040	T	6	6	42705	42710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012040	TAAA	2	8	42730	42737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012040	TCAAA	2	10	42744	42753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_012040	AAATT	2	10	42754	42763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012040	T	7	7	42762	42768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012040	ATTT	2	8	42769	42776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012040	TAAT	2	8	42784	42791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012040	T	6	6	42793	42798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012040	A	6	6	42840	42845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_012040	AGT	2	6	43188	43193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012040	T	6	6	43207	43212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012040	ATTT	2	8	43233	43240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_012040	TAAAT	2	10	43244	43253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012040	AAT	2	6	43273	43278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012040	AT	3	6	43277	43282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012040	ACTA	2	8	43305	43312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_012040	TAA	2	6	45132	45137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012040	T	6	6	45143	45148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012040	GTTTT	2	10	45150	45159	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012040	T	8	8	45156	45163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_012040	ATT	2	6	45166	45171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_012040	TA	3	6	45486	45491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_012040	A	6	6	45560	45565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012040	GTA	2	6	45567	45572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
193	NC_012040	A	6	6	45596	45601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012040	T	7	7	45610	45616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_012040	A	7	7	45675	45681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012040	TGA	2	6	45695	45700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_012040	A	6	6	45700	45705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012040	A	7	7	45728	45734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_012040	ATA	2	6	45759	45764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_012040	A	6	6	45776	45781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_012040	TGA	2	6	45788	45793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
202	NC_012040	A	6	6	45793	45798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_012040	ATAAA	2	10	45820	45829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_012040	AAT	2	6	45837	45842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_012040	A	7	7	45848	45854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_012040	ATGGAA	2	12	45916	45927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
207	NC_012040	CAA	2	6	45931	45936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
208	NC_012040	T	6	6	45981	45986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_012040	GGAA	2	8	46041	46048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
210	NC_012040	TA	3	6	46049	46054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_012040	AAG	2	6	46073	46078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
212	NC_012040	A	7	7	46102	46108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_012040	AATA	2	8	46136	46143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_012040	A	6	6	46168	46173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
215	NC_012040	TTA	3	9	46174	46182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_012040	AAT	2	6	46185	46190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.